
近日,中国生物上海生物制品研究所在国际肿瘤学权威期刊《Oncogene》发表题为“Characterisation of APOBEC3B-Mediated RNA editing in breast cancer cells reveals regulatory roles of NEAT1 and MALAT1 lncRNAs”的研究性论文。研究首次发现胞苷脱氨酶APOBEC3B能通过特定方式编辑RNA,从而促进肿瘤异质性形成,揭示了肿瘤异质性新机制。

肿瘤组织异质性,即肿瘤内部细胞在基因型、表型和生物学行为上的显著差异,一直是肿瘤精准诊断、治疗及相关药物研发的重大挑战,RNA编辑在肿瘤发生发展中起着关键作用。近年来,科学家长期致力于研究RNA编辑在肿瘤异质性中的作用,以便找到控制肿瘤异质性新的突破口。

▲肿瘤组织异质性是肿瘤治疗困难的来源(Dagogo-Jack and Shaw, Nature Reviews 2017)
本研究将诱导表达细胞模型与识别RNA差异变异 (DVR) 的新方法相结合,绘制了乳腺癌细胞模型中APOBEC3B介导的RNA编辑位点。研究发现,APOBEC3B通过C>U编辑改变RNA分子的结构和功能,特别是在NEAT1和MALAT1两种长链非编码RNA中进行广泛编辑。此类RNA虽不编码蛋白质,但在细胞调控中发挥重要作用。当非编码RNA与APOBEC3B结合时,能够抑制APOBEC3B对其他RNA分子的编辑活性,形成一种负反馈调节机制,从而抑制APOBEC3B在肿瘤细胞中的催化突变能力。这一发现为临床实践提供了调控APOBEC3B活性的新方法,有望在未来肿瘤诊疗中得到应用。
同时,APOBEC3B介导的RNA编辑可能改变此类抗原生成,NEAT1和MALAT1在调控APOBEC3B活性方面发挥的作用,可能会对肿瘤新生抗原的生成产生影响,从而增强免疫系统对肿瘤的攻击能力。基于此理论,通过结合RNA编辑调控和免疫学策略,有望开发新一代肿瘤治疗性疫苗。

▲APOBEC3B与NEAT1、MALAT1相互作用的发现

▲APOBEC3B蛋白与RNA分子(紫色)催化复合物的分子模型
基于本研究成果目前已获得2项中国发明专利授权,并得到上海市科委“浦江人才”计划、上海市科委“科技创新行动计划”项目支持。上海生物制品研究所张弛博士为该论文第一作者,李秀玲研究员、英国伦敦大学癌症研究院保罗•克拉克研究员为论文的通讯作者。

▲张弛课题组

近年来,上海生物制品研究所以临床需求为导向,聚焦创新药物靶标发现与验证研究,大力构建AI辅助药物研发平台,不断探索AI在药物研发中的新应用和新模式,进一步提高新药筛选效率和成功率,为公司新药研发提供更加高效、灵活和定制化的解决方案。
供稿|研发部


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