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    景杰云平台CUT&Tag分析工具首发:助力表观遗传研究的利器

    景杰云
    05/22
    22


    01

    什么是CUT&Tag?

    CUT&Tag(靶向切割转座技术)是Henikoff团队2019年开发的【表观遗传GPS】,通过抗体引导的DNA精准标记,可在全基因组范围内锁定转录因子、组蛋白修饰等蛋白的精确结合位点,分辨率较传统技术提升5倍,被《Nature》评为"表观研究里程碑式工具",景杰生物紧跟时代步伐,于2023年推出CUT&Tag产品,并迅速在市场上崭露头角,赢得众多老师的青睐!


    与ChIP-seq类似,CUT&Tag成败的关键因素之一是抗体的选择,景杰生物拥有自主抗体开发平台十余年的抗体开发经验,且在新型酰化修饰领域独树一帜,可为客户提供自研的ChIP级别抗体,决胜CUT&Tag关键环节。




    02

    全流程分析赋能机制挖掘

    CUT&Tag通过抗体精准靶向目的蛋白后,利用Tn5转座酶在目的位点附近切割DNA,并进行DNA结合区域的测序。拿到测序下机原始序列后,景杰生物生信部会提供包括序列质控序列比对peak富集peak基因注释功能富集差异分析的全流程数据分析报告,助力蛋白-DNA结合机制的挖掘。






    03

    云工具助力高分文章可视化

    在科研论文投稿过程中,可视化图片的质量往往直接影响着文章的接受率。为了让您的可视化图片更加出色,景杰生信云平台特别推出了CUT&Tag信号分布图CUT&Tag富集图两款小工具,为您的可视化需求保驾护航。

    • CUT&Tag信号分布图:精准呈现蛋白结合位点
    CUT&Tag信号分布图可通过热图或曲线图,展示目的蛋白结合的DNA序列在基因区域的分布情况,通过信号峰出现的位置,可以判断序列主要富集在基因的TSS(转录起始位点)、genebody或者TES(转录终止位点)附近,从而揭示目的蛋白与基因表达调控之间的关系。如下图,可以看到本课题研究的目的蛋白主要与基因的TSS(转录起始位点)结合从而调控基因表达。


    通过景杰生信云平台的CUT&Tag信号分布图工具,您可以实现在以下情形下的图片优化:

    1) 自由组合图表类型,在热图顶部同时增加曲线图,让您的图片类型更加丰富多样,满足不同期刊的投稿要求。

    2) 多样本热图合并,轻松实现多个样本热图的合并,使样本间的比较更加直观,一目了然。

    3) 个性化颜色设定,随心所欲修改热图中的颜色,让您的热图更具吸引力。

    4) 灵活调整图片高度,让图片的大小完美契合您的排版要求。



    • CUT&Tag富集图:揭示基因功能与代谢通路变化
    对Peak的邻近基因进行功能富集分析,有助于揭示目的蛋白调控的基因功能或代谢通路,在CUT&Tag项目中,我们使用R包clusterProfiler对注释到的Peak邻近基因进行GO和KEGG pathway富集分析,并对富集结果中的Top功能使用气泡图和条形图进行结果可视化。
    通过景杰生信云平台的CUT&Tag富集图工具,您可以实现在以下情形下的图片优化:

    1) 精准筛选,灵活调整显著性功能筛选指标及标准,确保分析结果的准确性和可靠性。

    2) 个性化展示,自定义标准挑选图片中展示的功能通路及数量,突出关键信息,让重点一目了然。

    3) 定制化需求,设置自定义展示功能名,满足您的个性化功能展示需求。

    4) 细节优化,支持图片中的字体大小、颜色设置和图片大小调整,让您的图表更加美观专业。





    04

    免费注册,开启科研新旅程

    看到这里,如果您对景杰云平台的CUT&Tag分析工具感兴趣,欢迎注册景杰生信云平台(http://www.ptm-biolab-css.com.cn/cloud/cloudTool),在这里,您将享受到全平台几十种工具(云工具)、教程视频(云课堂)、解读文档(云资源)全部免费使用的特权,工具中附带详细使用教程,让您轻松上手。同时,使用过程中的各种问题都有我们的客服助手小哥哥在线解答,确保您的科研之路畅通无阻~

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    景杰生物作为修饰组学领域的领跑者,拥有多种修饰抗体和修饰组学质谱检测服务。如果您想了解相关产品和服务的更多信息,请扫描下方二维码填写合作咨询表单、或咨询景杰生物销售工程师、或拨打科服热线400-100-1145。如有转载、投稿等其他合作需求,请在文章下方留言,或添加微信ptm-market咨询。

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